崙背奉天宮創建於清嘉慶二年(公元1797年)至今已將近二百年的歷史，奉祀主神為天上聖母，配祀:神農大帝、註生娘娘、福德正神，為崙背鄉內歷史最悠久的廟宇。
嘉慶初年本地連年苦旱五谷歉收，且瘟疫流行，莊民頻臨飢病交迫，人心惶恐之際，幸莊內有識人士廖清新先生提議，迎請湄洲媽祖聖駕繞境驅邪，祈安植福，果不其然媽祖神威顯赫，三日後疫疾頓然消蹟，萬物回春。於是集議興建一竹茅廟宇奉祀，於嘉慶二年竣工，定名「奉天宮」。自此以後每逢媽祖誕辰佳節，莊民莫不欣喜萬分齊聚慶祝，光緒十三年(公元1887年)重整廟宇。

民國二十年(公元1931年)地方士紳發起重建廟宇，向境內外信徒募捐，興建一棟佔地200坪，磚造瓦頂廟宇、巍峨堂皇。廟宇剪黏、彫刻均出自名匠之手，佈置莊嚴，技藝精巧，古色古香。重建後神威更加顯赫，香火益加鼎盛，庇佑地方更為繁榮。

奉天宮改築序：惟彼聖母，崙背名彰，奉天記跡，今古流長，靈分湄島，地接螺陽，慈航普濟，聖德無疆，庇民護國，永錫爾昌，風調雨順，惠及萬方，勝地鐘靈，千載流芳，道咸之世，建築尋常，宮堂剝蝕，灰瓦頹牆，地方有志，共議同商，當官屆出，許可憲章，捐金募集，人氣徜徉，喜輸不計，樂善徵祥，壬申之歲，改造棟樑，甲戌葭月，落成式張，碑文記載，名姓輝光，民國壬申年十一月立　鍾金標序，郭連海謹書。

民國五十六年經當時主任委員會李來枝等委員發起由本莊三村眾信徒樂捐，將廟貌重新油漆刷新。民國五十八年再翻修廟頂。

民國六十二年在廟左側再興建三層香客大樓二棟，可住宿七百人。


神蹟顯化
 

民國十四年歲次乙丑年農曆八月初三日本宮天上聖母，奉玉帝玉旨，代天巡狩出巡雲林縣內(虎尾溪北)各鄉鎮村落達十數天，當時媽祖聖駕所到之處，民眾都出莊迎接膜拜，莊內如有病人，祈求媽祖神靈庇佑均能一一痊癒，甚至有癒後親自到媽祖聖駕前叩謝。

第二次世界大戰未期，台灣時遭盟機轟炸，慘不堪言，本莊也屢遭空襲，無數次的轟炸與掃射在媽祖神威庇蔭之下，全莊信眾均能化險為夷，平安無事。

民國三十四年（昭和二十年），農曆三月十九日，盟機又在本莊空襲，投下一枚500公斤之炸彈，莊民大驚失色，幸哉，本宮天上聖母顯靈，將該枚炸彈引經本宮屋頂，並將炸彈信管抽出並卡在本宮屋頂龍鬚上，而炸彈繼續向下衝行，將距本宮五十公尺處之一口防火用儲水池衝碎，再衝斷一支電線桿後，向上衝入一棟木造樓房之二樓，停住在主人臥室房之床上，幸該炸彈信管已卡住本宮屋頂之龍鬚上，雖經衝撞亦未爆炸，附近居民幸免與難。日本軍方派員勘驗時，亦百思莫解，嘖嘖稱奇。
此次炸彈未爆事件，莊民咸認為媽祖顯靈，拯救黎民，莊民逐不顧日本警方對宗教信仰之禁令，紛紛到本宮參拜媽及眾神祇，遠近信眾來宮參拜者絡繹不絕，一時香火鼎盛，連日本警都無法阻止，竟解禁民眾對媽祖之信仰。

又於同年農曆四月某日下午本莊再遭受轟炸，盟機連續投下四枚炸彈，情況萬分危急，幸好媽祖又大發神威，將四枚炸彈引離莊外南方約1,000公尺處，始墜落在大排水溝底爆炸，留下四個大洞坑，並無人畜傷亡。如在莊內爆炸，後果就不堪設想。至今莊民尚津津樂道，念念不忘媽祖之大恩大德。

今後展望

台灣光復後宗教信仰自由，每月農曆初一、十五日，附近善男信女，前來參拜香膜拜者人山人海，香火鼎盛。甚至有全省各地香客專程前來參拜者。還有遠自基隆、七堵、暖暖、台北、景美、松山、萬華、大湳、花蓮、台東等地前來恭迎天上聖母神尊鎮宅奉祀或建廟祀奉者不勝枚舉。每年仍然有依例組團前來謁祖進香參拜者，絡繹於途熱鬧非常。

本宮為秉承媽祖普渡眾生，慈悲為懷精神，對內加強組織團體，對外加強聯繫服務社會，廣結善緣，造福人群。